Oito organizações compõem a Secretaria Executiva do FSM, que possui um escritório em São Paulo (Brasil), e é responsável pela coordenação do processo Fórum. Essa secretaria é formada pelas oito entidades que iniciaram a organização do primeiro FSM:


O Comitê Organizador brasileiro é formado por oito entidades:

ABONG - Associação Brasileira de Organizações Não Governamentais

ATTAC - Ação pela Tributação das Transações Financeiras em Apoio aos Cidadãos

CBJP - Comissão Brasileira Justiça e Paz, da CNBB

CIVES
- Associação Brasileira de Empresários pela Cidadania

CUT
- Central Única dos Trabalhadores

IBASE
- Instituto Brasileiro de Análises Sociais e Econômicas

MST
- Movimento dos Trabalhadores Rurais Sem Terra
Rede Social de Justiça e Direitos Humanos


Quando o FSM transferiu-se para Mumbai, foi criado um Comitê Organizador Indiano (responsável pela organização do FSM 2004 em Mumbai, na Índia) – que foi integrado depois à Secretaria do FSM.

As questões políticas gerais e a discussão sobre os rumos do FSM e as metodologias dos eventos anuais são debatidas e encaminhadas no âmbito do Conselho Internacional, formado atualmente por 129 organizações.

Para a quinta edição do FSM , foi constituído um Comitê Organizador Brasileiro (COB) formado por 23 organizações, subdivididas em oito GTs: Espaços, Economia Popular Solidária, Meio Ambiente e Sustentabilidade, Cultura, Tradução, Comunicação, Mobilização, Software Livre (articulado com o GT de Comunicação).